Mažiems šiltnamiams naudojamos įvairios medžiagos, daugiausia stiklinės, saulės plokštės, plastikinės plėvelės, aliuminio lydiniai ir kt. Stiklo šiltnamiuose kaip pagrindinė šviesą praleidžianti dangos medžiaga naudojamas stiklas, pasižymintis ilgaamžiškumu ir tinkamumu įvairiems regionuose ir klimato sąlygomis, tačiau pasižymi didelėmis sąnaudomis ir prasta šilumos izoliacija. Šiltnamiai nuo saulės yra gaminys, pakeičiantis tradicinius plastikinės plėvelės šiltnamius ir stiklinius šiltnamius. Jie pasižymi geru šviesos pralaidumu, mažu šilumos laidumu, lengvu svoriu ir gražia išvaizda, tinka vietoms, kuriose pučia stiprus vėjas ir lyja. Plastikinės plėvelės yra polietileno (PE), etileno-vinilacetato (EVA), polivinilchlorido (PVC) ir poliolefino (PO) plėvelės, kurios dažnai naudojamos kaip šiltnamių dengiamoji medžiaga. Jie yra lengvi ir ekonomiški, tačiau palyginti mažai patvarūs. Aliuminio lydiniai dėl gero atsparumo korozijai ir lengvumo dažnai naudojami šiltnamių vėdinimo sistemose ir plastikinių plėvelių tvirtinimo komponentuose.
Mažiems šiltnamiams, ypač mažiems namams ar kiemams skirtiems šiltnamiams, be gamybinių šiltnamių aplinkos savybių, jie pabrėžia ir estetiką bei laisvalaikio funkcijas. Todėl, be šviesos pralaidumo, ilgaamžiškumo ir sąnaudų, medžiagų pasirinkimas taip pat gali apimti tokius veiksnius kaip grožis ir įrengimo bei priežiūros paprastumas. Pavyzdžiui, saulės skydelis yra viena iš pageidaujamų medžiagų mažiems šiltnamiams dėl gero šviesos pralaidumo ir lengvumo. Be to, medžiagų pasirinkimas taip pat skirsis priklausomai nuo regiono klimato sąlygų. Pavyzdžiui, šaltose patalpose gali būti naudojamos medžiagos, kurių šilumos izoliacija yra geresnė.
